Badania naukowe wskazują, że aceton nie jest substancją toksyczną ani rakotwórczą. Nawet przypadkowe spożycie jego niewielkich ilości nie powinno wywołać żadnych poważnych dolegliwości. Niemniej jednak, aceton to substancja drażniąca, dlatego będąc wystawionym na jej długotrwałe działanie, można nabawić się negatywnych skutków ubocznych. Chodzi przede wszystkim o wdychanie oparów acetonu, dlatego używając go, zawsze warto otwierać okno.